继续教育学院（校企合作中心）的前身是九江船舶工业公司培训中心，创办于1984年，主要承担九江地区船舶企业职工的培训任务，1995年成立江西广播电视大学九江船舶工业公司分校，举办了电大普通专科教育，1999年培训中心改制并入九江职业技术学院，成立成人教育部，2010年更名为继续教育部，2013年更名为中职与继续教育学院，2017年更名为继续教育学院，并同校企合作中心合署办公。
继续教育学院（校企合作中心）下设综合管理科、培训管理科、培训规划科、社会培训科、学历教育科、社区教育科、师资培训科、校企合作科八个职能科室，统一负责学校各类非学历教育及非全日制成人学历教育、社区教育工作，统筹、协调和管理全校的校企合作项目，并承担江西国防科技工业职业教育集团秘书处工作。
继续教育学院依托学校国家示范性高职的优质办学资源和船舶行业特色，积极开展非全日制成人学历教育、非学历教育及社区教育。自1999年起，经江西省教育厅批准，先后同北京理工大学、大连海事大学、江西师范大学、江苏科技大学、哈尔滨工程大学、西南科技大学和中央广播电视大学等院校合作，实现优势互补、资源共享，不断提升办学层次、拓展办学渠道，相继举办高等学历继续教育（函授、业余）、远程（开放）教育、网络教育等形式的专、本科教育，累计培养在职人员7400余人；自2004年起，经国家海事局和江西省地方海事局核验批准，面向江西省所有地区内河船舶船员，承担起适任统考、基本安全、特殊船舶、游艇操作人员等培训任务，共计开展各类船员培训400余期，累计完成船员培训21000余人次，为江西省地方航运事业的发展做出了巨大的贡献；2016年为更好地服务服务社区教育和终身学习，同濂溪区人民政府合作成立了濂溪社区学院，为濂溪区居民提供教育服务；为进一步发挥学校教育资源优势，服务区域经济发展，2019年联合九江市总工会成立了九江市新时代产业工人学院，联合企业共建华林金建和检安石化职工培训基地，面向企业职工开设新型学徒制培训、企业员工岗前、在岗培训、职业技能培训服务；2020年同九江市企业联合会合作成立了浔商商学院，为九江市企业开设中高端管理人才教育培训；2021年同九江市建设监理有限公司成立九职监理学院，面向九江市建筑管理人才提供培训服务；2019年获批教育部职业院校校长培育基地，面向中高职学校校长进行培训。为贯彻落实国家乡村振兴发展战略，服务地方经济社会发展，2020年起积极开展高素质农民培训，为九江培养更多新时代职业农民。
学校根据创建中国特色高水平高职院校工作要求，紧紧抓住军民融合国家战略新机遇，主动契合船舶军工行业及江西省支柱产业发展新需求，校企先后共建一批产业学院、企业工作室、实践教学基地等合作平台，推进产业引领专业发展，全面推进现代学徒制人才培养和任务式培养模式，先后与京东集团、中兴通讯、联想集团等156家国内知名企业建立了深度合作关系,共建校内实操实训室等56个、校内生产性实习基地6个、校外实习基地305个，接受顶岗实习学生3661人、就业学生2319人。2020年，中央电视台新闻联栏目，以“深化产教融合，职业教育产业发展赋能”为题报道了产教融合、校企合作典型案例。2022年，以联合企业攻关成果和助力企业提升经济效益内容，形成典型案例，该案例成功获得江西卫视《江西新闻联播》报道。
2020年，由我校牵头的“江西国防科技工业职业教育集团”被评为全国首批示范性职业教育集团，牵头成立江西省职业院校G10联盟，助推江西省职业教育创新发展。集团以深化产教融合、校企合作，创新技术技能人才系统培养机制为核心，对接区域重点产业、优势产业、新兴产业和特色产业的发展需要，不断加强政府、行业、园区、企业、学校之间的全方位合作。现已总结4个教育部现代学徒制专业试点成功经验，推广9个省级现代学徒制项目建设。集团内校企开设订单班156个，学生6641人；组织专场招聘会、校企对接会等59次，集团内就业学生2839名；组织参与省级以上各类竞赛活动，集团内学生在国省赛获奖359项，其中国赛一等奖21项。
我们坚信：依托学校，突出特色，发挥优势，面向社会需求，提升办学质量，学校继续教育事业和校企合作工作一定会在发展中不断创新，在创新中实现可持续发展。